Рейтинг подготовлен Московским центром непрерывного математического образования при содействии Министерства образования и науки РФ.

Данный список составляется ежегодно с 2013 года. Среди главных критериев отбора – результаты основного государственного экзамена и Всероссийской олимпиады школьников. В частности, в Топ-500 лучших школ страны-2016 вошли гимназия №1 Ульяновска и городская гимназия Димитровграда. Данные общеобразовательные учреждения уже четвёртый раз попадают во Всероссийский перечень.

Кроме того, Московский центр непрерывного математического образования подготовил Топ-200 сельских общеобразовательных организаций. В него вошла Новомалыклинская школа имени Героя Советского Союза М.С. Чернова. «Список лучших сельских школ страны составляется третий раз, и нас отмечают каждый год. Для нас это общественное признание. Тем более эта новость совпала с радостным событием – педагог нашей школы вошёл в число лучших в стране: Ришат Калимуллин стал лауреатом Всероссийского конкурса «Учитель года-2016», – отметила директор Новомалыклинской школы имени Героя Советского Союза М.С. Чернова Алсу Хамидуллина.

Также в перечень лучших общеобразовательных организаций 2016 года по физико-математическому профилю попал ульяновский лицей №38.